More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0914 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  100 
 
 		 290 aa  591  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  73.79 
 
 		 290 aa  431  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  50 
 
 		 295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  46.67 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  44.48 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.1 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  44.29 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.29 
 
 		 291 aa  255  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  45.33 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  45.67 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  44.36 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  40.21 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  38.36 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  37.97 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  39.86 
 
 		 294 aa  205  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  36.81 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  36.65 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  38.79 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  37.01 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  37.01 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  37.01 
 
 		 292 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  37.01 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  37.04 
 
 		 290 aa  188  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  46 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  35.66 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  43.06 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  33.99 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  34.86 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  33 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  36.48 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.92 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  37.62 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  33.92 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.05 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  36.19 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  37.22 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  33.71 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  34.18 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  30.49 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  35.07 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  35.43 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.53 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.22 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  30.91 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  34.51 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  33.64 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  34.1 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  31.25 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.32 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  35.65 
 
 		 350 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  32.74 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  43.78 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  38.29 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  37.62 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  35.24 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  35.24 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.93 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.25 
 
 		 315 aa  148  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  35.78 
 
 		 339 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  31.9 
 
 		 316 aa  148  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.94 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  35 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  35.29 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  31.9 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  31.64 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.04 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.94 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  33.78 
 
 		 326 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.7 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>