More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26380 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 251 aa  490  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  47.95 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  46.96 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  39.27 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.44 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  35.71 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  37.33 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  40.62 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.82 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  40.77 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  46.01 
 
 		 284 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  41.78 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  38.53 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 287 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.36 
 
 		 299 aa  155  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  42.48 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  39.29 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0482  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.8 
 
 		 301 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  37.28 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  40.35 
 
 		 288 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  34.07 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  34.75 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  37.67 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  37.39 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  38.29 
 
 		 310 aa  148  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  39.13 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.81 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  36.49 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  38.05 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.9 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.89 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 308 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 308 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  38.18 
 
 		 292 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  38.36 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  34.36 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.1 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  38.18 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  35.84 
 
 		 311 aa  141  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 311 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  31.56 
 
 		 301 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  34.53 
 
 		 328 aa  140  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  38.18 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.07 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  31.56 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  34.21 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  38.5 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  34.22 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  38.62 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  33.33 
 
 		 360 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  40.71 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  34.98 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.16 
 
 		 308 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  38.6 
 
 		 311 aa  138  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  36.89 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 312 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.87 
 
 		 325 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  42.6 
 
 		 342 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  36.11 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  42.2 
 
 		 304 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  33.19 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  36.16 
 
 		 311 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 312 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  34.07 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  35.91 
 
 		 294 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  36.11 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  39.29 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  37.05 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  39.56 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  37.93 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 369 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  36.92 
 
 		 316 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  39.82 
 
 		 332 aa  135  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.7 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>