More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13250 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  43.06 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  37.33 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  44.55 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  41.15 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  34.42 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  39.55 
 
 		 296 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.31 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.97 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.68 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.81 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  38.97 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  32.57 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  42.36 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  42.51 
 
 		 284 aa  141  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  42.56 
 
 		 286 aa  141  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  37.26 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 296 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  39.05 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  33.79 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 299 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  36.11 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.97 
 
 		 307 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  40.4 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  40.69 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  36.98 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  37.19 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  37.19 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  37.19 
 
 		 292 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  37.19 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  35.5 
 
 		 301 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  33.06 
 
 		 289 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  34.27 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  38.04 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  30.88 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  34.43 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  31.78 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  36.59 
 
 		 253 aa  128  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  30.99 
 
 		 309 aa  128  9.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  37.25 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  34.53 
 
 		 311 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  31.34 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  36.36 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  32.72 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 328 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  33.49 
 
 		 360 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  39.02 
 
 		 304 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  32.68 
 
 		 305 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.73 
 
 		 310 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  39.02 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0482  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  39.02 
 
 		 326 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  39.02 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  32.85 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  39.02 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  34.15 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  36.45 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  34.09 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  35.59 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.33 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  36.87 
 
 		 308 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  38.35 
 
 		 373 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  34.88 
 
 		 339 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  38.54 
 
 		 320 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  37.25 
 
 		 322 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  32.24 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.4 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 334 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  35.12 
 
 		 305 aa  121  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  25.86 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 311 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  34.43 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  34.43 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  32.86 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  36.04 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  35.98 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  36.36 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  30.66 
 
 		 369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  30.57 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  33.49 
 
 		 344 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  36.15 
 
 		 332 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  33.65 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  36.32 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>