More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05240 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 239 aa  480  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0482  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 247 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  41.63 
 
 		 251 aa  161  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  40.26 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  38.43 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  34.35 
 
 		 289 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.72 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  37.79 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.48 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.25 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.72 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.09 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  33.93 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  31.44 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  32.46 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  37.61 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  35.6 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 288 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  30.47 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  35.87 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 		 292 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  36.94 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.52 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  33.61 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  33.61 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  36.2 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  33.61 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  33.61 
 
 		 292 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  34.44 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  33.33 
 
 		 305 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  34.27 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 341 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 351 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  31.88 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  32.29 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.69 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  32.27 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  37.87 
 
 		 325 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.33 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  37.33 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  29.54 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.17 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 296 aa  121  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  37.1 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 286 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  35.26 
 
 		 295 aa  121  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.13 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.76 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  30.9 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  32.27 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  32.02 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  30.09 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 312 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  29.41 
 
 		 310 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  28.77 
 
 		 312 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  32.54 
 
 		 302 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 312 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  31.49 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  32.54 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  32.37 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  36.16 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  32.37 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  33.18 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  33.18 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  32.37 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  31.25 
 
 		 651 aa  119  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  28.77 
 
 		 312 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 312 aa  118  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  28.77 
 
 		 312 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 312 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 312 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  30.21 
 
 		 308 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4184  daunorubicin resistance ABC transporter ATP- binding subunit  36.21 
 
 		 328 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00696491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  29.68 
 
 		 303 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  31.06 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 302 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.04 
 
 		 307 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  31.34 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  32.37 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  29.91 
 
 		 320 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  31.06 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  32.06 
 
 		 302 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  31.06 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  29.65 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  33.94 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  32.73 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  33.03 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  34.27 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>