More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3995 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  100 
 
 
286 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  75.27 
 
 
288 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  54.74 
 
 
290 aa  289  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  55.59 
 
 
295 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  42.41 
 
 
289 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  46.48 
 
 
295 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  46.32 
 
 
300 aa  234  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  46.9 
 
 
284 aa  233  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  39.93 
 
 
294 aa  232  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  43.99 
 
 
307 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  46.02 
 
 
297 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  49.57 
 
 
292 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  49.57 
 
 
292 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  49.57 
 
 
292 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  49.57 
 
 
292 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  45.8 
 
 
293 aa  225  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  42.28 
 
 
299 aa  224  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 
292 aa  221  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.64 
 
 
299 aa  221  9e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  41.61 
 
 
287 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 
293 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  43.88 
 
 
296 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.6 
 
 
291 aa  217  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  40.21 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  38.46 
 
 
295 aa  212  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  39.86 
 
 
301 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  43.62 
 
 
292 aa  208  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 
282 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  39.1 
 
 
303 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  46.5 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
288 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  39.31 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  36.81 
 
 
295 aa  191  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 
301 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
308 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  48.56 
 
 
267 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  46.61 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  37.59 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  40.38 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  41.77 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  40.41 
 
 
326 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  35.43 
 
 
309 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  40.43 
 
 
305 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.16 
 
 
369 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  43.35 
 
 
316 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  39.24 
 
 
310 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.32 
 
 
306 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  39.66 
 
 
360 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  41.18 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  40.52 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  31.45 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  36.29 
 
 
298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  40.81 
 
 
320 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  40.81 
 
 
320 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  40.24 
 
 
325 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
305 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 
311 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  36.9 
 
 
339 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  37.96 
 
 
313 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  38.16 
 
 
240 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.36 
 
 
317 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  40.27 
 
 
328 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 
308 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  39.64 
 
 
316 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40.91 
 
 
344 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  37.55 
 
 
313 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  38.7 
 
 
327 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
305 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  39.38 
 
 
321 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
312 aa  158  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  31.93 
 
 
301 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  40.35 
 
 
306 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
248 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
302 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  41.59 
 
 
304 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
322 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
313 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 
302 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  41.99 
 
 
331 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 
302 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
309 aa  157  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  42.16 
 
 
323 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  38.96 
 
 
292 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.56 
 
 
308 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  41.52 
 
 
302 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.98 
 
 
337 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  42.36 
 
 
318 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.32 
 
 
315 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.49 
 
 
327 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
305 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
976 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  36.13 
 
 
308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  43.52 
 
 
311 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  37.46 
 
 
336 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
318 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.32 
 
 
305 aa  155  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.48 
 
 
251 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0843722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>