More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4743 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  100 
 
 		 267 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  68.46 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.35 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  49.53 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  41.9 
 
 		 295 aa  194  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  46 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  44.96 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  49.05 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  44.09 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  42.72 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  44.09 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.63 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  48.56 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  42.38 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  42.38 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  42.38 
 
 		 292 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  42.93 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.09 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  42.16 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  41.4 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  42 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  41.92 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 292 aa  175  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  43.72 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  45.89 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  42.86 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  40.45 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  42.72 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  45.24 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.31 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  44.23 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  40.91 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  40.09 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  37.44 
 
 		 306 aa  158  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  40.29 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  40.29 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.04 
 
 		 244 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  37.55 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  43.84 
 
 		 318 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  40.87 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  42 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  37.1 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  37.34 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  35.44 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  40.18 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  39.8 
 
 		 309 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.26 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0482  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  43.84 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  39.44 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  40.58 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  40.41 
 
 		 360 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  40.09 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.38 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  41.44 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.49 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  35.08 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  35.08 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  35.56 
 
 		 904 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 312 aa  148  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  36.82 
 
 		 244 aa  149  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  34.68 
 
 		 244 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.73 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  37.25 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  35.08 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 		 317 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  41.5 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  35.91 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  44.95 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  33.62 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  39.01 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  34.27 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  34.68 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  34.27 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  37.5 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.67 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  38.14 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  35.47 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  42.45 
 
 		 306 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>