More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0134 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  43.03 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  42.86 
 
 
267 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
255 aa  168  8e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  38.37 
 
 
253 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  41.01 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  40.72 
 
 
289 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
308 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.43 
 
 
239 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
287 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  35.9 
 
 
301 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  38.53 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.18 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.05 
 
 
234 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  39.06 
 
 
284 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  33.03 
 
 
295 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 
411 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.24 
 
 
251 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
336 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
309 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  39.35 
 
 
288 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
248 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.41 
 
 
299 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 
307 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.09 
 
 
369 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  32.6 
 
 
295 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  36.77 
 
 
294 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  37.22 
 
 
293 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  37.56 
 
 
286 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  36.28 
 
 
344 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  38.01 
 
 
296 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  35.62 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  38.39 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  35.29 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  36.53 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  36.04 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  33.94 
 
 
341 aa  139  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  36.97 
 
 
329 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.42 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.38 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  38.59 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  38.54 
 
 
300 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  33.03 
 
 
322 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  34.55 
 
 
360 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  34.25 
 
 
308 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.78 
 
 
291 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
286 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.05 
 
 
301 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  35.74 
 
 
295 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  34.25 
 
 
319 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  36.2 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.85 
 
 
244 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  34.26 
 
 
307 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  34.2 
 
 
292 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  32.54 
 
 
510 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
311 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 
308 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.31 
 
 
333 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  34.2 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  34.2 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  34.25 
 
 
320 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  34.25 
 
 
320 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  34.2 
 
 
292 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
333 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.63 
 
 
353 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  35.24 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  36.89 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  35.4 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.1 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  36.57 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  33.19 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  33.48 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  34.02 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  37.21 
 
 
325 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  35.91 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.88 
 
 
325 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
299 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  36.68 
 
 
236 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  34.43 
 
 
309 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  32.73 
 
 
310 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  36.93 
 
 
342 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  33.8 
 
 
299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  33.78 
 
 
339 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  33.78 
 
 
339 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
242 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.78 
 
 
368 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  32.52 
 
 
339 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
318 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  32.55 
 
 
305 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.09 
 
 
355 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  34.98 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  36.32 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>