More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1835 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  100 
 
 
295 aa  598  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  52.56 
 
 
296 aa  332  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  45.8 
 
 
293 aa  279  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.98 
 
 
299 aa  270  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.79 
 
 
291 aa  264  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  47.2 
 
 
295 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  45.33 
 
 
290 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
286 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  41.49 
 
 
289 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  36.75 
 
 
284 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 
290 aa  215  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 
297 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  35.05 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  38.11 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  39.65 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  38.28 
 
 
294 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  36.81 
 
 
286 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  37.54 
 
 
287 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 
293 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  35.52 
 
 
292 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  35.52 
 
 
292 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  35.17 
 
 
292 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  35.52 
 
 
292 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  35.45 
 
 
290 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  36.25 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  33.79 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  36.78 
 
 
288 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  35.85 
 
 
288 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 
307 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  34.83 
 
 
299 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  35.21 
 
 
308 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  38.18 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  43.36 
 
 
302 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  43.36 
 
 
302 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  37.73 
 
 
307 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
301 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
301 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  34.62 
 
 
295 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  32.99 
 
 
300 aa  168  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.71 
 
 
251 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 
307 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
307 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  39.17 
 
 
246 aa  165  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  36.32 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  40 
 
 
267 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  37.39 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  36.82 
 
 
306 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  35.59 
 
 
308 aa  160  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  37.33 
 
 
325 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  35.15 
 
 
296 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.33 
 
 
234 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  34.47 
 
 
306 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
309 aa  157  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  36.94 
 
 
317 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
369 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  35.59 
 
 
316 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  37.83 
 
 
236 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.89 
 
 
282 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  34.42 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.97 
 
 
311 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  33.77 
 
 
308 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  35.45 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.94 
 
 
312 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  34.54 
 
 
344 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  34.38 
 
 
305 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  33.33 
 
 
344 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  32.73 
 
 
253 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.79 
 
 
314 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  33.7 
 
 
303 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.96 
 
 
298 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  32.88 
 
 
320 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  32.96 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  31.62 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  33.21 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.05 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  31.38 
 
 
319 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.12 
 
 
299 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  32.24 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
255 aa  145  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  32.2 
 
 
351 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  32.2 
 
 
351 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  32.2 
 
 
306 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  32.2 
 
 
304 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  32.2 
 
 
304 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  32.2 
 
 
304 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  29.84 
 
 
328 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  32.2 
 
 
304 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  33.64 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  31.82 
 
 
329 aa  145  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  33.94 
 
 
240 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  33.77 
 
 
316 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  33.58 
 
 
303 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  34.18 
 
 
315 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
261 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  30.93 
 
 
313 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>