More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0454 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  69.62 
 
 		 267 aa  301  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  46.34 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  50.96 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.5 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  41.7 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 		 255 aa  184  8e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  42.06 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  37.33 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  43.03 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  43.06 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  47.85 
 
 		 290 aa  178  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  40.81 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  44.5 
 
 		 293 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  46.61 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  38.18 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  42.16 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  40.45 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  46.05 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  37.78 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.06 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.19 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  40.44 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  42.79 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  38.94 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.45 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.9 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  40.67 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  40.18 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.63 
 
 		 239 aa  161  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  37.84 
 
 		 292 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  37.84 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  37.84 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  38.7 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  40.71 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  37.33 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  38.01 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  40.53 
 
 		 329 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0482  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  35.43 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  40.64 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  41.59 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.26 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  38.59 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 292 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.11 
 
 		 310 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  39.34 
 
 		 316 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  39.6 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  35.04 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  39.15 
 
 		 314 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  38.46 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 308 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 286 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  35.65 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.03 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  42.79 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  37.67 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 		 309 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.85 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  38.57 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 336 aa  152  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  37.5 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  35.96 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  40.35 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  35.96 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  40.96 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  37.72 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.2 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  38.21 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  40.36 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  35.96 
 
 		 328 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  35.86 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 		 307 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 314 aa  148  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  36.63 
 
 		 325 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  41.12 
 
 		 373 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  40 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.48 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  35.75 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  39.81 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 317 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>