More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4876 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  60.48 
 
 		 292 aa  364  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  61.19 
 
 		 300 aa  357  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  57.99 
 
 		 292 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  57.29 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  57.29 
 
 		 292 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  57.29 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  56.94 
 
 		 292 aa  339  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  57.09 
 
 		 295 aa  338  9e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  54.98 
 
 		 294 aa  335  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  57.29 
 
 		 293 aa  335  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  54.48 
 
 		 300 aa  325  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  42.91 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  43.94 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  42.28 
 
 		 286 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  40.55 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  40.83 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  41.08 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  38.54 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  38.89 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  40.28 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  38.14 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  38.51 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  38.75 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  41.24 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  38.14 
 
 		 301 aa  198  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.45 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.46 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  37.37 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  34.83 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  36.39 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  40.44 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 		 411 aa  162  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  41 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  39.39 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  39.47 
 
 		 360 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 369 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  40.26 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4107  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  38.33 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.4 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  40.59 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.5 
 
 		 240 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.92 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40.87 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  38.16 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  34.07 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  32.37 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  37.17 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  37.83 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  36.11 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  37.83 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  36.55 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  39.58 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.91 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  39.33 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  33.01 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  38.11 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  38.11 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  37.83 
 
 		 331 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  33.02 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  38.7 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.71 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  31.21 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  32.48 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  35.84 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  38.84 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  40.52 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  38.72 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.55 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  36.9 
 
 		 337 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  40 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  36.96 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  39.66 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.4 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.57 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  36.96 
 
 		 328 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.91 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  38.75 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  40 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.98 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.19 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  35.71 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  40 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>