More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1750 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
292 aa  597  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  93.84 
 
 
292 aa  563  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  93.49 
 
 
292 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  93.15 
 
 
292 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  93.49 
 
 
292 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  81.57 
 
 
293 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  62.67 
 
 
292 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  61.77 
 
 
295 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  57.75 
 
 
294 aa  347  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  60.92 
 
 
300 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  57.99 
 
 
299 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  57.14 
 
 
300 aa  335  5.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  43.79 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  40.75 
 
 
301 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  39.12 
 
 
290 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  47.86 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  42.71 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.04 
 
 
299 aa  219  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  42.8 
 
 
284 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  39.66 
 
 
289 aa  215  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  40.99 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  38.16 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
297 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.4 
 
 
291 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
287 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  41.99 
 
 
303 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  44.89 
 
 
295 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  36.65 
 
 
290 aa  191  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 
282 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  39.85 
 
 
296 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  34.48 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
289 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  38.64 
 
 
288 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  39.09 
 
 
240 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
290 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
308 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  40.44 
 
 
301 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  37.39 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  41.43 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  37.01 
 
 
310 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
310 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 
303 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  40.18 
 
 
313 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  37.21 
 
 
310 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  35.1 
 
 
336 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 
310 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  37.39 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.89 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.27 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.45 
 
 
315 aa  155  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35 
 
 
328 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.94 
 
 
328 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  36.61 
 
 
337 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  37.01 
 
 
337 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.12 
 
 
319 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  38.39 
 
 
310 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  38.39 
 
 
317 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  38.5 
 
 
315 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
369 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  34.12 
 
 
253 aa  152  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  37.95 
 
 
310 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  35.53 
 
 
251 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 
310 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  37.95 
 
 
310 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
311 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  37.05 
 
 
310 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  33.86 
 
 
360 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  36.4 
 
 
310 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  35.71 
 
 
338 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  38.81 
 
 
298 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
315 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  35.32 
 
 
307 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.67 
 
 
325 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
309 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.37 
 
 
279 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  38.22 
 
 
311 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  33.6 
 
 
307 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  35.87 
 
 
306 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  33.59 
 
 
337 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  35.32 
 
 
320 aa  148  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  38.5 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.16 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  37.18 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  33.98 
 
 
593 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  37.99 
 
 
304 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  37.99 
 
 
304 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  35.83 
 
 
318 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  34.75 
 
 
304 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  39.55 
 
 
303 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  37.09 
 
 
331 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  35.59 
 
 
287 aa  146  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.18 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>