More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0094 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 255 aa  527  1e-149  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.49 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  40.5 
 
 		 251 aa  184  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  41.2 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.02 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.09 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  39.64 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  40.09 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  35.98 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.71 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  39.72 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  39.42 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0482  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  36.75 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  38.14 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 288 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  38.1 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  38.1 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  33.33 
 
 		 317 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  38.79 
 
 		 290 aa  151  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 		 282 aa  149  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  38.39 
 
 		 331 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  35.55 
 
 		 328 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  37.91 
 
 		 296 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  35.56 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  36.04 
 
 		 331 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  34.19 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  35.91 
 
 		 295 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  36.32 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  33.48 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.24 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  35.71 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  36.14 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  35.07 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  37.67 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  37.5 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  34.29 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.09 
 
 		 369 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  33.04 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.7 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  34.84 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  34.17 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  33.91 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  34.43 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  33.64 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  34.43 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  36.53 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  34.22 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.6 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.15 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.4 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  36.28 
 
 		 594 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.79 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  30.74 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  33.79 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  34.43 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  37.25 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  34.7 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  38.18 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  37.95 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 		 301 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  35.82 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.27 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.4 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.25 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  34.63 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  34.7 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  38.05 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  38.05 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  38.05 
 
 		 292 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.15 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  38.05 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  33.02 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.32 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  37.81 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  38.05 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 292 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  33.18 
 
 		 307 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.53 
 
 		 240 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  35.27 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>