More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3211 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  44.6 
 
 
289 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  43.99 
 
 
286 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
288 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  43.1 
 
 
290 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  40.93 
 
 
293 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.85 
 
 
291 aa  218  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.86 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  42.71 
 
 
296 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  39.5 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  39.65 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  39.5 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  39.5 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  39.5 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  39.02 
 
 
300 aa  211  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  42.71 
 
 
295 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  39.51 
 
 
301 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  39.3 
 
 
295 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  39.79 
 
 
282 aa  205  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
299 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  39.51 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  35.07 
 
 
294 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  40 
 
 
295 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  39.86 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  37.37 
 
 
292 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 
297 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  42.79 
 
 
306 aa  191  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  37.63 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  38.41 
 
 
286 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
287 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  37.63 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  37.41 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  40.09 
 
 
328 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  40 
 
 
308 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  40.09 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  42.04 
 
 
240 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  37.24 
 
 
295 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  40.66 
 
 
360 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  39.47 
 
 
307 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  40.09 
 
 
319 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  41.8 
 
 
267 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  36.6 
 
 
298 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.69 
 
 
305 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  40.85 
 
 
303 aa  175  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40.62 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  39.82 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  39.82 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
290 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  38.66 
 
 
310 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  40.65 
 
 
339 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  39.64 
 
 
299 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  44.5 
 
 
251 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  38.64 
 
 
369 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
315 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  40.85 
 
 
336 aa  167  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.18 
 
 
301 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  41.23 
 
 
308 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  35.71 
 
 
253 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  45.23 
 
 
311 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  40.09 
 
 
325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  35.42 
 
 
316 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  36.84 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  34.67 
 
 
329 aa  165  9e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.11 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  37.23 
 
 
315 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  41.98 
 
 
317 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  36.44 
 
 
308 aa  163  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
307 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  38.29 
 
 
235 aa  162  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  38.07 
 
 
236 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 
309 aa  161  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 
308 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  33.59 
 
 
337 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
322 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  33.91 
 
 
583 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.72 
 
 
307 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.44 
 
 
316 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.44 
 
 
316 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
301 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.24 
 
 
244 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  32.69 
 
 
316 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 
301 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  36.45 
 
 
309 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 
302 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 
302 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  38.07 
 
 
317 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  35.75 
 
 
317 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  35.59 
 
 
335 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.36 
 
 
305 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  41.03 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  42 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  35.96 
 
 
323 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  37.1 
 
 
310 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.16 
 
 
303 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  39.3 
 
 
279 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  38.12 
 
 
327 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>