More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5232 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  60 
 
 		 295 aa  363  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  58.42 
 
 		 294 aa  359  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  63.03 
 
 		 292 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  62.68 
 
 		 292 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  62.32 
 
 		 292 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  62.32 
 
 		 292 aa  349  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  60.92 
 
 		 292 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  60.21 
 
 		 293 aa  344  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  58.33 
 
 		 292 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  59.09 
 
 		 300 aa  340  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  54.48 
 
 		 299 aa  325  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  42.11 
 
 		 284 aa  234  9e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  46.32 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  41.61 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  43.31 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  43.11 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  39.66 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  41.64 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  38.85 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 307 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.93 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  43.71 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  36.65 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.01 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  40.21 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  39.01 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  43.53 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  36.25 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  34.19 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 288 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35 
 
 		 240 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  38.94 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  40.45 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  34.19 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  34.19 
 
 		 338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  33.87 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  36.92 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  36.92 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  36.54 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.07 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  35.11 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  32.06 
 
 		 337 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  33.55 
 
 		 338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  32.06 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.22 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  40.37 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.78 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  33.33 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  39.34 
 
 		 248 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 248 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.78 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  35.19 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4107  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  35.59 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  36.94 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  36.28 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.34 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.71 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.91 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  33.09 
 
 		 339 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  32.79 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.77 
 
 		 411 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  34.18 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  33.72 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  36.24 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.68 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 		 328 aa  148  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  33.56 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  38.05 
 
 		 328 aa  148  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.68 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  32.48 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.94 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  30.52 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  36 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.53 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  37.55 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>