More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1930 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  100 
 
 
258 aa  512  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  74.27 
 
 
250 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  72.61 
 
 
246 aa  353  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  72.61 
 
 
247 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  72.61 
 
 
247 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  72.2 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  64.88 
 
 
257 aa  315  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  65.42 
 
 
264 aa  315  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  64.46 
 
 
253 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  63.67 
 
 
252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  64.14 
 
 
243 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  66.52 
 
 
242 aa  300  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  63.03 
 
 
259 aa  295  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  61.98 
 
 
270 aa  295  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  62.14 
 
 
246 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  66.81 
 
 
271 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  61.25 
 
 
244 aa  284  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  60.74 
 
 
256 aa  278  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  55.6 
 
 
259 aa  248  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.84 
 
 
270 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
254 aa  237  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 
266 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  49.79 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 
249 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 
249 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  48.74 
 
 
255 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  48.32 
 
 
255 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 
249 aa  224  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.46 
 
 
255 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.7 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 
281 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
284 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 
255 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
254 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
281 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.38 
 
 
256 aa  215  7e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
395 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
440 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 
273 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  45.06 
 
 
239 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
453 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  42.92 
 
 
240 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.42 
 
 
277 aa  201  8e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.26 
 
 
277 aa  201  9e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
456 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 
411 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  41.56 
 
 
380 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.4 
 
 
398 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  43.35 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.17 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  41.95 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.37 
 
 
276 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.37 
 
 
403 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 
402 aa  194  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 
281 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.65 
 
 
283 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 
310 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.08 
 
 
284 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.99 
 
 
285 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  36.02 
 
 
283 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  41.95 
 
 
568 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 
541 aa  188  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.08 
 
 
288 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  41.77 
 
 
244 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  41.7 
 
 
303 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
280 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 
285 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
256 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
280 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
280 aa  185  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  38.24 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.11 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.73 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 
280 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.82 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.82 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.73 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  37.82 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.82 
 
 
300 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.95 
 
 
270 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  42.37 
 
 
571 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.07 
 
 
281 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 
280 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.65 
 
 
288 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  37.25 
 
 
275 aa  179  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 
285 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  40.43 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  38.43 
 
 
283 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  38.43 
 
 
283 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.93 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  39.18 
 
 
290 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 
276 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>