More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1694 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  66.22 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  62.38 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  62.05 
 
 		 303 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  62.38 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  61.87 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  62.05 
 
 		 303 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  60.71 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2284  ABC transporter related  62.88 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  61.54 
 
 		 301 aa  381  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  61.92 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  60.54 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  61.59 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  60.93 
 
 		 302 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 301 aa  331  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  34.44 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  40 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  38.65 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.93 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  40.76 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  37.98 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  37.98 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  37.32 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  36.36 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  32.7 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.71 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  32.5 
 
 		 339 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  35.71 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  41.31 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  35.94 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  35.74 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  33.49 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  30.58 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  35.89 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  36.84 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  35.41 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.91 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  34.88 
 
 		 327 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  34.55 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  37.74 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  30.97 
 
 		 320 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.45 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.67 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.54 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  30.62 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  37.38 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  36.62 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.19 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.23 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  37.91 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  34.76 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  37.2 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.29 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  38.5 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.91 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  30.68 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  35.53 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.19 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  33.02 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  35.07 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  35.68 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.17 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  32.86 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  38.43 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.41 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  36.79 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  37.62 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  36.79 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  35.68 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  35.68 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  31.22 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  29.5 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  32.49 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  35.21 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  37.09 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  39.15 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  31.88 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  32.05 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.21 
 
 		 326 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>