More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0521 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  100 
 
 
301 aa  598  1e-170  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  54.48 
 
 
297 aa  338  5e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  36.88 
 
 
311 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  33.94 
 
 
302 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  41.47 
 
 
332 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  34.88 
 
 
301 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  33.55 
 
 
301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  34.75 
 
 
300 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  42.29 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  37.44 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.78 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  40.25 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.98 
 
 
337 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.03 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  34.83 
 
 
302 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  37.5 
 
 
297 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  42.33 
 
 
876 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  38.79 
 
 
308 aa  162  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  41.9 
 
 
301 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0816  ABC transporter related protein  33 
 
 
305 aa  160  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.286081  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 
316 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  36.97 
 
 
310 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  41.4 
 
 
301 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  42.92 
 
 
339 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  33.56 
 
 
300 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  39.83 
 
 
897 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  42.79 
 
 
309 aa  159  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.72 
 
 
247 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.45 
 
 
312 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
242 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 
318 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.85 
 
 
322 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  39.91 
 
 
236 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  34.85 
 
 
306 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  43.32 
 
 
309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  43.14 
 
 
318 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
302 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
237 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  38.56 
 
 
337 aa  155  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  39.75 
 
 
285 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  35.51 
 
 
310 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  38.05 
 
 
342 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  40.26 
 
 
301 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  38.74 
 
 
339 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4184  daunorubicin resistance ABC transporter ATP- binding subunit  37.02 
 
 
328 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00696491  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.17 
 
 
303 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
331 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  43.63 
 
 
318 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
310 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  34.56 
 
 
299 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
309 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  32.87 
 
 
310 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.4 
 
 
316 aa  153  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  34.27 
 
 
968 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 
316 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  38.74 
 
 
339 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  38.74 
 
 
339 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.66 
 
 
321 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  39.61 
 
 
305 aa  152  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.49 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  35.71 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.01 
 
 
944 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.17 
 
 
312 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  40.09 
 
 
866 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.77 
 
 
332 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
309 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 
309 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  34.56 
 
 
976 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 
309 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 
317 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
304 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
250 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  37.61 
 
 
295 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
301 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  33.01 
 
 
322 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  32.24 
 
 
337 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  33.47 
 
 
298 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  40 
 
 
868 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  44.21 
 
 
316 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  34.98 
 
 
310 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  38.25 
 
 
1010 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  40.38 
 
 
328 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.77 
 
 
307 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 
309 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.61 
 
 
345 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.13 
 
 
317 aa  149  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
305 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  34.58 
 
 
304 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  34.2 
 
 
329 aa  149  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  36.49 
 
 
323 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.46 
 
 
309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 
323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.51 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.52 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.07 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  36.29 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  36.89 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>