More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1408 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1408  ABC transporter related  100 
 
 
303 aa  594  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.021534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 
337 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.43 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.68 
 
 
312 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.43 
 
 
324 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.1 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  35.76 
 
 
311 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.81 
 
 
327 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.05 
 
 
308 aa  170  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.91 
 
 
338 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.49 
 
 
338 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.9 
 
 
345 aa  168  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5258  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.58 
 
 
330 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.78 
 
 
339 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.2 
 
 
343 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.19 
 
 
327 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 
331 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.22 
 
 
321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.69 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2896  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 
339 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.76 
 
 
334 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.27 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4511  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.19 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.69 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  38.39 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.05 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1684  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.32 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000329487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.36 
 
 
304 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 
322 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.43 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.79 
 
 
353 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4550  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 
314 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0235657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.48 
 
 
333 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 
316 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  36.57 
 
 
345 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  34.64 
 
 
355 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.46 
 
 
319 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
320 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.01 
 
 
316 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1124  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
311 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.87 
 
 
305 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23580  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 
324 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  41.05 
 
 
295 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  34.84 
 
 
310 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.67 
 
 
347 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1353  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.79 
 
 
320 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101008  normal  0.136194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3548  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.02 
 
 
335 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.45 
 
 
330 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2293  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 
327 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352429  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  35.87 
 
 
301 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
308 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.16 
 
 
312 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.1 
 
 
319 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.35 
 
 
316 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  36.36 
 
 
327 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  36.54 
 
 
320 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  37.62 
 
 
344 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.19 
 
 
741 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.18 
 
 
446 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.34 
 
 
348 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  35.92 
 
 
342 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1744  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.69 
 
 
325 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000031377 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  31.58 
 
 
316 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0177  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.01 
 
 
329 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0504097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  36.48 
 
 
303 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 
324 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2364  ABC transporter related  35.35 
 
 
327 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021349  normal  0.0168897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  36.01 
 
 
321 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.01 
 
 
310 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.41 
 
 
309 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.5 
 
 
338 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  35.14 
 
 
314 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6786  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 
322 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00659712  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  34.74 
 
 
355 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  37.29 
 
 
306 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  37.29 
 
 
304 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  37.29 
 
 
304 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 
317 aa  155  8e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  37.29 
 
 
304 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 
327 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  37.29 
 
 
351 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.6 
 
 
326 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  36.42 
 
 
344 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  37.29 
 
 
351 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
341 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  37.7 
 
 
304 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  35.69 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.17 
 
 
308 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  35.6 
 
 
304 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.19 
 
 
331 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 
359 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  35.92 
 
 
304 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  36.01 
 
 
320 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.78 
 
 
335 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  35.92 
 
 
304 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 
317 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2708  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.57 
 
 
329 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  29.77 
 
 
308 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  36.01 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>