More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0289 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  89.6 
 
 		 404 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  100 
 
 		 404 aa  813    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.16 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  31.08 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  27.01 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.14 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.65 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.01 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.57 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  31.43 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  31.75 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  27.91 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.38 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  29.79 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  27.86 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  29.97 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  26.88 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  28.82 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.13 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  29.81 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.71 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  28.47 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  24.18 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.95 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  26.96 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  28.9 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  27.39 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  27.79 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  27.04 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  30.37 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  29.14 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  24.3 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.19 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  26.7 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.98 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  27.11 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  27.11 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.33 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  29.24 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  25.27 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.55 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.14 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.75 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  29.65 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.74 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.43 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  27.78 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  31.66 
 
 		 389 aa  97.1  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  28.46 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  28.85 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.34 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  29.06 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  26.84 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  30.71 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  26.24 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  22.7 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  27.34 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  28.79 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.28 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  30.8 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  27.01 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.3 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  26.99 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  30.53 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  28.49 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  31.29 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  29.44 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  25.44 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  25 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  25.27 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  26.19 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  27.91 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  29.88 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1594  ROK family protein  24.94 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  26.65 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  27.81 
 
 		 429 aa  90.1  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  27.11 
 
 		 379 aa  89.7  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  28.9 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.09 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  30.2 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  26.01 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  27.23 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  28.85 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  29.29 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  30.12 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  27.46 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  27.55 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  26.55 
 
 		 404 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  24.21 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2517  xylose repressor  22.6 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.53 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0032  ROK family protein  22.6 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  24.16 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0032  ROK family protein  22.6 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  22.22 
 
 		 396 aa  86.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  25.31 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  27.14 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  28.57 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  29.93 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  30.06 
 
 		 324 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>