More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5366 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  88.57 
 
 		 210 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  45.32 
 
 		 213 aa  187  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  48.02 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 228 aa  174  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  47.74 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 247 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  36.02 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  32.97 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 273 aa  95.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  32.95 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  40.24 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  31.51 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.37 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  26.37 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.37 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.37 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.37 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>