174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2732 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 219 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  36.49 
 
 		 227 aa  134  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  36.19 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  37.98 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  36.55 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  36.24 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  35.78 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  36.5 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  35.32 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  32.66 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  29.74 
 
 		 247 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  47.31 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  35 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 251 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  36.88 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  35.42 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  35.42 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  35.42 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  28.97 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  28.97 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  28.97 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  28.97 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  29.66 
 
 		 179 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  28.28 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  28.28 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  41.79 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  35.8 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  27.59 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  25.38 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  23.74 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  44.26 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 180 aa  51.6  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.34 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  29.67 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  23.79 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  24.62 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  38.81 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.27 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  27.74 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  27.1 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  31.37 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  27.1 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  39.06 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  39.06 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  28.07 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  25.33 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  22.77 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  27.11 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>