268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4057 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 325 aa  675    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  78.57 
 
 		 326 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  32.62 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  30.35 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  30.95 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  27.38 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  29.69 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  27.61 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  29.84 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  36.27 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  33.5 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  33.66 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  34.72 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  33.66 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  33 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  32.51 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  33.5 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  26.57 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  32.02 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  26.95 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 270 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 270 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  33.8 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  32.51 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  33.8 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  31.78 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  27.33 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  27.61 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  26.91 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  28.27 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  31.5 
 
 		 200 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  29.91 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  27.17 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  32.95 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  28.57 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  29.44 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.61 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  27.2 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.65 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.51 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  27.49 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  26.79 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  29.73 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  24.62 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.44 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.04 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  28.12 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  25.44 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  25.44 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.43 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  30.19 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  28.5 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  23.63 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  29.73 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  25.6 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  25.85 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  25.14 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  28.57 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  28.82 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  29.39 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  28.05 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  29.26 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  30.51 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.53 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  30.66 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  26.14 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  28.32 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.66 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  24.66 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  30.22 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.12 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1885  phage integrase-like SAM-like  30.43 
 
 		 190 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.618174  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  27.22 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  27.37 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.05 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  25 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.16 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  29.21 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  26.34 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  25.82 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 451 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  25.82 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  30.51 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  24.59 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  25.18 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  30.54 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>