More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1647 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 317 aa  647    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  28.21 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  28.92 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  28.36 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  28.15 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  33.19 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.62 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.43 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  27.71 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.45 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  27.94 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.54 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.62 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.64 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  27.48 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  27.8 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  26.6 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  28.34 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.57 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  27.69 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.48 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.48 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.14 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  30.94 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  23.37 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  27.87 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.7 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.91 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  27.97 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  29.26 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  29.43 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  27.84 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.55 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  26.84 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  28.09 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.25 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  27.99 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.06 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  26.16 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.7 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  28.34 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  26.01 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.11 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.86 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  30.28 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  23.68 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  29.66 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  29.43 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  27.04 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.81 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.86 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.63 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  27.67 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  26.6 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.63 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  27.55 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.53 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>