More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6308 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  98.15 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  73.11 
 
 		 214 aa  325  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  67.48 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  52.31 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  41.71 
 
 		 247 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  40.98 
 
 		 247 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  37.38 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  36.54 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.46 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  32.44 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  31.53 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.78 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  31.71 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  26.79 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  30.58 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.84 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.84 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.84 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.84 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.24 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.46 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  29.18 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.37 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.63 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.37 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  31.11 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  31.11 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  31.11 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  28.51 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.46 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.27 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.18 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.73 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.78 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  33.17 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.17 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.13 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  27.59 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  27.09 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  27.09 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  37.27 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.8 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.6 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  36.19 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  25.45 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>