82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2388 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  47.12 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  45.23 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  39.15 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  37.86 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  36.41 
 
 		 237 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  35.2 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  31.25 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  28.44 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  26.94 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  32.69 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  26.94 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  33.81 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  30.52 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  33.33 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  29.95 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  27.48 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  31.28 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  30.1 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  30.19 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  32.04 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  27.75 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  30.19 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  24.88 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  24.88 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  32.04 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  24.88 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  24.88 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  32.35 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  27.98 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  23.56 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  24.4 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  28.57 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  28.57 
 
 		 259 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  24.52 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  24.06 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  31.68 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  27.4 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  28.17 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  28.24 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  29.31 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  26.03 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  27.18 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  27.1 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  26.7 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  27.1 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  41.98 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  27.62 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  27.05 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  34.06 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.92 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  29.15 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  27.54 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  27.54 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  27.54 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  39.71 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  30.43 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  44.26 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  40.58 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  25.62 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  38.81 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1035  hypothetical protein  42.42 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  38.36 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  34.85 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  37.1 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  41.94 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  50.98 
 
 		 127 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  22.86 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  36.76 
 
 		 343 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  33.33 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  41.94 
 
 		 129 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  27.44 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  22.38 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  34.19 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  37.7 
 
 		 282 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  33.93 
 
 		 225 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  40.79 
 
 		 157 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  31.94 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  27.2 
 
 		 132 aa  41.2  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>