More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1482 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 518 aa  1064    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  47.69 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  47.69 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  47.54 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  47.69 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  47.69 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  47.69 
 
 		 552 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  47.45 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1469  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  47.45 
 
 		 530 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  47.69 
 
 		 530 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  46.54 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  46.03 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  46.3 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  44.64 
 
 		 564 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  47.2 
 
 		 528 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2530  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  46.98 
 
 		 547 aa  372  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 		 525 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  46.35 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  46.72 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  46.47 
 
 		 529 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 		 525 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  46.47 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 		 564 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  46.08 
 
 		 516 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  45.82 
 
 		 516 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  40.3 
 
 		 556 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.87 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  47.18 
 
 		 451 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  39.83 
 
 		 580 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  44.82 
 
 		 511 aa  347  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  41 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  45.56 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  43.19 
 
 		 504 aa  342  7e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  42.89 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  41 
 
 		 534 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2337  Lytic transglycosylase catalytic  43.17 
 
 		 538 aa  336  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 515 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  42.24 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  44.58 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.34 
 
 		 554 aa  329  8e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  39.07 
 
 		 534 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1461  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0063107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2292  Lytic transglycosylase catalytic  48.51 
 
 		 458 aa  325  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.97 
 
 		 530 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  40.77 
 
 		 498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 548 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.33 
 
 		 528 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1320  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  47.87 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367153  normal  0.0421613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  35.78 
 
 		 539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  38.31 
 
 		 511 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  38.49 
 
 		 519 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.85 
 
 		 552 aa  311  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.39 
 
 		 527 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1021  lytic transglycosylase, catalytic  48.51 
 
 		 477 aa  306  8.000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.847474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  36.71 
 
 		 527 aa  306  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  38.74 
 
 		 517 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  37.85 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.27 
 
 		 532 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.28 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  39.83 
 
 		 515 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  39.69 
 
 		 473 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  38.46 
 
 		 479 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  39.52 
 
 		 515 aa  289  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  38.41 
 
 		 479 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  36.6 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  39.3 
 
 		 515 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  39.52 
 
 		 515 aa  286  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  38.6 
 
 		 515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  37.91 
 
 		 476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  38.53 
 
 		 515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  38.6 
 
 		 515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  38.53 
 
 		 519 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  37.3 
 
 		 514 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  39.81 
 
 		 476 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  39.81 
 
 		 476 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 		 492 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  35.95 
 
 		 524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  34.7 
 
 		 539 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  39.85 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.74 
 
 		 499 aa  270  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  36.51 
 
 		 487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  34.06 
 
 		 550 aa  266  8.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  36.38 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  33.84 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  35.56 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  37.34 
 
 		 445 aa  256  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  35.31 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  33.82 
 
 		 442 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  34.06 
 
 		 442 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  35.05 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  31.12 
 
 		 546 aa  230  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 		 477 aa  229  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.44 
 
 		 544 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  34.61 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  33.17 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  34.14 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  42.35 
 
 		 1001 aa  227  4e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.35 
 
 		 455 aa  227  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>