More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3399 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  100 
 
 		 2096 aa  4217    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  38.13 
 
 		 1271 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  31.4 
 
 		 2035 aa  579  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  29.31 
 
 		 2149 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1942 aa  555  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  34.48 
 
 		 3027 aa  553  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  28.13 
 
 		 1840 aa  516  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1669 aa  505  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1917 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  33.79 
 
 		 2277 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  33.93 
 
 		 1352 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  29.16 
 
 		 3689 aa  426  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  27.37 
 
 		 1953 aa  427  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  32.7 
 
 		 1600 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1959 aa  421  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  33.71 
 
 		 1485 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.84 
 
 		 3073 aa  358  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.88 
 
 		 2731 aa  342  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  28.33 
 
 		 1467 aa  305  8.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 3273 aa  298  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.79 
 
 		 1485 aa  290  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1586 aa  290  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.62 
 
 		 1576 aa  281  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1390 aa  280  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  29.98 
 
 		 2294 aa  278  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.79 
 
 		 1579 aa  277  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.79 
 
 		 1428 aa  277  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1197 aa  276  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.84 
 
 		 1560 aa  272  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.96 
 
 		 1362 aa  271  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1520 aa  271  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1527 aa  269  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1547 aa  268  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.17 
 
 		 1381 aa  267  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.46 
 
 		 1488 aa  266  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  30.25 
 
 		 2003 aa  264  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.61 
 
 		 1568 aa  264  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1551 aa  263  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1550 aa  262  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.37 
 
 		 1518 aa  261  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1620 aa  258  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1541 aa  257  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1541 aa  257  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1541 aa  257  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.81 
 
 		 1609 aa  256  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  25.49 
 
 		 1541 aa  256  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  31.48 
 
 		 927 aa  256  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1541 aa  255  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1381 aa  255  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.7 
 
 		 1599 aa  255  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.61 
 
 		 1614 aa  255  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1553 aa  254  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1541 aa  254  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  30.09 
 
 		 3193 aa  253  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  26.7 
 
 		 1593 aa  252  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1602 aa  251  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1531 aa  249  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.58 
 
 		 1489 aa  249  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  28.54 
 
 		 924 aa  248  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.34 
 
 		 1528 aa  246  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.37 
 
 		 1595 aa  247  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.39 
 
 		 1259 aa  246  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 2374 aa  245  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1433 aa  245  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.91 
 
 		 1572 aa  244  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1554 aa  242  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.27 
 
 		 1586 aa  242  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.06 
 
 		 1434 aa  241  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.35 
 
 		 1626 aa  240  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  24.4 
 
 		 1495 aa  234  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  24.36 
 
 		 1543 aa  231  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1611 aa  231  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1552 aa  231  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  24.85 
 
 		 1539 aa  229  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.38 
 
 		 1528 aa  227  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  28.41 
 
 		 903 aa  227  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.74 
 
 		 1530 aa  226  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  25.72 
 
 		 1681 aa  225  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1495 aa  225  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1419 aa  224  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1400 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  24.17 
 
 		 1573 aa  223  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.9 
 
 		 1429 aa  222  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  25.44 
 
 		 1446 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  24.91 
 
 		 1539 aa  221  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1411 aa  221  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.71 
 
 		 2942 aa  221  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  28.12 
 
 		 1008 aa  220  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  28.12 
 
 		 1008 aa  220  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.45 
 
 		 1509 aa  219  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  28.15 
 
 		 1345 aa  219  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  28.15 
 
 		 1345 aa  219  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.61 
 
 		 1348 aa  219  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  28.35 
 
 		 889 aa  219  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.55 
 
 		 1385 aa  218  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1466 aa  217  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1494 aa  217  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  24.92 
 
 		 1379 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.33 
 
 		 1981 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.11 
 
 		 1508 aa  216  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>