114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1177 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  100 
 
 		 383 aa  790    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  45.89 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  42.54 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  36.94 
 
 		 373 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  36.26 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  37.57 
 
 		 360 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4252  integrase family protein  71.97 
 
 		 132 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.354411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  37.7 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  33.53 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  34.34 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  34.95 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  32.95 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  28.28 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  28.16 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3883  putative site-specific integrase/recombinase  88.52 
 
 		 66 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.353137  normal  0.0700878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  29.93 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  27.32 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  28.32 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  23.71 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  26.98 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  23.37 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  24.01 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  25 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  25 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  23.75 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  32.16 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  25.46 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  22.51 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  22.49 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  23.99 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.03 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.63 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  32.86 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  29.12 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  32.86 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  33.57 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.73 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  33.57 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.37 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  24.68 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.41 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  30.09 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  24.58 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  23.41 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.13 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  24.04 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  25.47 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  25.36 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.27 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.11 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.11 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  24.52 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  24.04 
 
 		 339 aa  50.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  32.59 
 
 		 197 aa  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  29.02 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  25.19 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 367 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.14 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  23.84 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  27.49 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  31.37 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.75 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  34.68 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.64 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  26.89 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  31.17 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  25.53 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  31.25 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  26.49 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  26.9 
 
 		 334 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.77 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.77 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  22.85 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  26.09 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  27.01 
 
 		 328 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25.32 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  22.87 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  22.7 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  26.84 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  21.34 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  26.77 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2418  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  22.87 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  22.29 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  22.85 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  26.5 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.06 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.66 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  28.21 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>