More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3023 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  83.56 
 
 		 239 aa  380  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  83.56 
 
 		 239 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  83.56 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  77.39 
 
 		 231 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  74.89 
 
 		 230 aa  357  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  74.89 
 
 		 230 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  76.62 
 
 		 234 aa  356  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  73.68 
 
 		 233 aa  352  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  75 
 
 		 232 aa  352  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  74.55 
 
 		 227 aa  351  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  75.89 
 
 		 228 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  74.22 
 
 		 228 aa  342  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  73.91 
 
 		 227 aa  339  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  72.32 
 
 		 234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  71.43 
 
 		 234 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  69.68 
 
 		 247 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  69.6 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  62.95 
 
 		 230 aa  295  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  53.95 
 
 		 389 aa  254  9e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  53.12 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  53.95 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  55.95 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  55.56 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  55.11 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  53.88 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  53.12 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  53.78 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  49.09 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  54.02 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  52.07 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  50.87 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  50.23 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  52.65 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  49.11 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  52.65 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  52.65 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  50.22 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  49.55 
 
 		 232 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  49.33 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  47.93 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  51.3 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  51.3 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  46.22 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  49.11 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  46.64 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  52.78 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  44.89 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  41.37 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  36.97 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  35.85 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  34.43 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  36.02 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  32.69 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  32.21 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  32.21 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  32.21 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33.51 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  32.21 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.97 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.14 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.5 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 201 aa  95.1  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.5 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  31.11 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.02 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  43.53 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>