More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0026 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  53.16 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  34.29 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  33.96 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  28.97 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1789  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00598195  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  25.32 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 245 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 245 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 247 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 235 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  48.5  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  24.76 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  37.23 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  29.93 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  31.58 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>