More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1064 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  100 
 
 
591 aa  1194  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  66.54 
 
 
542 aa  721  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  65.64 
 
 
556 aa  711  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  65.8 
 
 
551 aa  689  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  45.83 
 
 
797 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  47.84 
 
 
549 aa  491  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  44.66 
 
 
682 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  47.08 
 
 
609 aa  480  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  47.06 
 
 
549 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  48.22 
 
 
628 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  46.14 
 
 
791 aa  471  1e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  44.25 
 
 
749 aa  470  1e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  44.31 
 
 
558 aa  466  1e-130  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  44.82 
 
 
640 aa  465  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  43.96 
 
 
654 aa  452  1e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  42.7 
 
 
547 aa  452  1e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  43.8 
 
 
1319 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  41.76 
 
 
831 aa  426  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  43.23 
 
 
1335 aa  428  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  40.79 
 
 
847 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  51.29 
 
 
1255 aa  408  1e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  44.57 
 
 
692 aa  405  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 
583 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  42.89 
 
 
770 aa  391  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
545 aa  373  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
991 aa  350  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  36.54 
 
 
722 aa  348  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  45.12 
 
 
612 aa  341  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
510 aa  306  5e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
519 aa  300  7e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
671 aa  299  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  38.24 
 
 
604 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  34.58 
 
 
610 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.94 
 
 
491 aa  277  4e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  39.34 
 
 
620 aa  275  2e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  38.89 
 
 
617 aa  274  4e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  33.99 
 
 
492 aa  270  4e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  38.15 
 
 
622 aa  268  3e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  33.99 
 
 
492 aa  266  7e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  38.17 
 
 
618 aa  265  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  35.36 
 
 
547 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.36 
 
 
489 aa  261  2e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  33.2 
 
 
549 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  36.63 
 
 
513 aa  252  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  35.46 
 
 
557 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  34.42 
 
 
557 aa  250  6e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  36.68 
 
 
557 aa  246  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  36.27 
 
 
512 aa  243  5e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  32.13 
 
 
543 aa  242  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  32.98 
 
 
577 aa  243  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  34.9 
 
 
546 aa  239  7e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  35.16 
 
 
546 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  34.9 
 
 
546 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  34.38 
 
 
546 aa  238  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
572 aa  237  5e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  32.99 
 
 
557 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
552 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
548 aa  227  5e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
552 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  36.1 
 
 
544 aa  223  9e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  36.08 
 
 
559 aa  219  8e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  34.13 
 
 
553 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  34.13 
 
 
553 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  34.13 
 
 
553 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  34.13 
 
 
553 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  36.54 
 
 
311 aa  203  9e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.45 
 
 
473 aa  199  1e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  31.3 
 
 
476 aa  195  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  34.61 
 
 
515 aa  186  1e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  32.98 
 
 
463 aa  175  2e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
521 aa  173  7e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  34.59 
 
 
477 aa  173  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  35.17 
 
 
478 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
463 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  35.62 
 
 
438 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
487 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
594 aa  170  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.8 
 
 
453 aa  170  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  32.37 
 
 
465 aa  170  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47512e-06 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.35 
 
 
444 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  36.01 
 
 
454 aa  168  3e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  35.73 
 
 
468 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  30.96 
 
 
498 aa  167  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  36.62 
 
 
460 aa  167  6e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
445 aa  167  7e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
472 aa  166  1e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  34.32 
 
 
563 aa  166  1e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  34.38 
 
 
468 aa  166  1e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  33.5 
 
 
464 aa  166  1e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  30.79 
 
 
481 aa  165  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.46 
 
 
463 aa  165  2e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  34.04 
 
 
412 aa  165  2e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  34.88 
 
 
465 aa  165  2e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  32.73 
 
 
572 aa  165  2e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  35.94 
 
 
634 aa  165  2e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.48 
 
 
462 aa  165  2e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  33.93 
 
 
442 aa  165  2e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
467 aa  165  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.56 
 
 
473 aa  165  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32.17 
 
 
569 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>