More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3115 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 276 aa  534  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  56.74 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  53.79 
 
 		 293 aa  238  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.01 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  55.26 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  42.31 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  39.22 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  39.93 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  42.86 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  36.49 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  37.23 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  36.36 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  37.45 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  37 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  37.05 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  37 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  36.63 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  36.08 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  38.89 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  37.82 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  36.88 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  36.88 
 
 		 306 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  34.07 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  37.77 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  38.52 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  36.88 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  37.77 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.1 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.1 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.1 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  38.03 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  39.13 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  38.3 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  33.21 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  38.24 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.74 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  36.79 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  37.29 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  37.13 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  38.44 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  38.04 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  34.8 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  37.59 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  39.26 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  34.53 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03577  citrate lyase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13030)  36.91 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  31.52 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.36 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  41.52 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  37.04 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  39.56 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  38.46 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  34.86 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  37.78 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  40.14 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  42.03 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  43.55 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  40 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  35.53 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  34.91 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.91 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.91 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  39.79 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  34.06 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  36 
 
 		 379 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  35.51 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  35 
 
 		 406 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  40.15 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  35.62 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  40.15 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  40.15 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.06 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  40.36 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  34.75 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  35.64 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  33.93 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  36.27 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  42.16 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  37.27 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  36.46 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  35.4 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  39.27 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  34.48 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.4 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.4 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.4 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.04 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  35.93 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  41.42 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2314  citrate (pro-3S)-lyase  44.29 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  37.06 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  32.5 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  34.67 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  36.93 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.4 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  34.67 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  33.21 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  37.01 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  37.01 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>