More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2047 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  100 
 
 		 323 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  39.03 
 
 		 407 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  41.9 
 
 		 330 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  38.95 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  40.6 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  34.52 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  34.04 
 
 		 574 aa  145  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  39.71 
 
 		 674 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  40.09 
 
 		 555 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  33.82 
 
 		 944 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.99 
 
 		 1103 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  36.12 
 
 		 623 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  37.82 
 
 		 598 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.65 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  34.83 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  31.99 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  31.65 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  33.89 
 
 		 579 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  32.66 
 
 		 546 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  31.65 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  33.86 
 
 		 531 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  31.31 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.71 
 
 		 552 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  31.94 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  35.8 
 
 		 539 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  35.39 
 
 		 528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.7 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  34.6 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  32.17 
 
 		 503 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  31.97 
 
 		 533 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  30.58 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  30.09 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.77 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  29.68 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  31.6 
 
 		 552 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  29.9 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  27.51 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  45.38 
 
 		 545 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  29.72 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  32.39 
 
 		 546 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  35.98 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  34.85 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  33.64 
 
 		 491 aa  99.4  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  29.08 
 
 		 558 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  31.91 
 
 		 534 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  30.3 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  28.99 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  28.37 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  30.2 
 
 		 563 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  26.2 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  26.41 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  34.47 
 
 		 539 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  35.35 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  32.88 
 
 		 529 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  26.97 
 
 		 353 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  32.05 
 
 		 551 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.77 
 
 		 391 aa  92.8  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  35.18 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  30.64 
 
 		 775 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  36.71 
 
 		 506 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  30.77 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  35.32 
 
 		 447 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  35.32 
 
 		 447 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  37.78 
 
 		 560 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  30.57 
 
 		 549 aa  87  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  30.89 
 
 		 552 aa  85.9  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  30.89 
 
 		 552 aa  85.9  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  27.8 
 
 		 548 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.81 
 
 		 555 aa  83.2  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  30.91 
 
 		 548 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  29.35 
 
 		 551 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  29.27 
 
 		 571 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  31.28 
 
 		 547 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  30.93 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  30.45 
 
 		 563 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  32.37 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31.58 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  29.61 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  36.21 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.97 
 
 		 550 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  33.87 
 
 		 550 aa  76.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  28.51 
 
 		 490 aa  75.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  30.14 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  26.3 
 
 		 591 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  30.67 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  28.87 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  29.78 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  34.75 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.41 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  30.2 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.41 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  26.52 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  31.38 
 
 		 1247 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  29.1 
 
 		 550 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  27 
 
 		 568 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  34.43 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  28.96 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  32.61 
 
 		 542 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.96 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  37.3 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>