More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0312 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  54.19 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  51.72 
 
 		 203 aa  218  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  27.17 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  39.16 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.12 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  35.87 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.21 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.21 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.21 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  25.58 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  51.06 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.94 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>