More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0846 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  60.15 
 
 		 532 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  64.03 
 
 		 531 aa  667    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  63.43 
 
 		 530 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  62.31 
 
 		 532 aa  664    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 533 aa  1064    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  58.78 
 
 		 526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  52.08 
 
 		 524 aa  495  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  52.06 
 
 		 533 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  47.09 
 
 		 532 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  46.97 
 
 		 533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  45.88 
 
 		 532 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  45.49 
 
 		 533 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  47.86 
 
 		 525 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  46.68 
 
 		 533 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  46.96 
 
 		 533 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  45.85 
 
 		 530 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  44.57 
 
 		 530 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  43.71 
 
 		 534 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.36 
 
 		 535 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  43.94 
 
 		 594 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  43.94 
 
 		 594 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  42.21 
 
 		 521 aa  392  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.76 
 
 		 856 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  40.3 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  43.06 
 
 		 632 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  41.87 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  42.86 
 
 		 632 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  43.23 
 
 		 618 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  40.75 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  41.15 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  40.3 
 
 		 526 aa  374  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  41.27 
 
 		 632 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  41 
 
 		 533 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  41.19 
 
 		 533 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  40.74 
 
 		 532 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  40.78 
 
 		 533 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  42.47 
 
 		 622 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  39.14 
 
 		 522 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 		 534 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  41.92 
 
 		 640 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  40.4 
 
 		 535 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  41.36 
 
 		 533 aa  363  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  40.89 
 
 		 533 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  39.68 
 
 		 554 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.96 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.02 
 
 		 853 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  40.19 
 
 		 625 aa  352  8.999999999999999e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  40.87 
 
 		 531 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  41.44 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  39.74 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  40.92 
 
 		 532 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  41.27 
 
 		 614 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  42.42 
 
 		 604 aa  350  4e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  41.52 
 
 		 554 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  42 
 
 		 614 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  41.25 
 
 		 626 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  38.36 
 
 		 526 aa  347  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  38.18 
 
 		 526 aa  347  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.88 
 
 		 856 aa  346  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  38.36 
 
 		 526 aa  345  8e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  40.48 
 
 		 554 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.48 
 
 		 554 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 532 aa  345  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  37.36 
 
 		 535 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  36.89 
 
 		 613 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  40.47 
 
 		 622 aa  342  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  38.79 
 
 		 512 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  40.8 
 
 		 609 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  37.05 
 
 		 613 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  39.92 
 
 		 636 aa  340  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  40.27 
 
 		 622 aa  338  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.3 
 
 		 844 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.71 
 
 		 839 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  42.34 
 
 		 621 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  41.22 
 
 		 633 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  41.83 
 
 		 607 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  40.18 
 
 		 623 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  40.2 
 
 		 621 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  40.24 
 
 		 627 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39 
 
 		 845 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  39.39 
 
 		 626 aa  333  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1331  protein-export membrane protein SecD  40.26 
 
 		 625 aa  333  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0264501  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.82 
 
 		 844 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 		 616 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  40.94 
 
 		 607 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  40.36 
 
 		 594 aa  330  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.73 
 
 		 848 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  40.23 
 
 		 618 aa  329  6e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  38.34 
 
 		 843 aa  329  7e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.34 
 
 		 834 aa  329  7e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  35.74 
 
 		 613 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.66 
 
 		 849 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2212  protein-export membrane protein SecD  40.93 
 
 		 620 aa  329  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363799  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  40.48 
 
 		 556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 		 629 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 		 629 aa  326  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1696  preprotein translocase subunit SecD  41.25 
 
 		 618 aa  325  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  40.44 
 
 		 621 aa  325  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3885  preprotein translocase subunit SecD  40.88 
 
 		 625 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  36.73 
 
 		 551 aa  322  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>