More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2210 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  100 
 
 		 438 aa  901    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  42.07 
 
 		 440 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  41.47 
 
 		 441 aa  323  5e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  40.09 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  38.76 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  43.54 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  40.42 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  38.34 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  40.05 
 
 		 449 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  38.85 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  38.32 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  38.52 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.93 
 
 		 429 aa  280  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  37.47 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.6 
 
 		 430 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  36.71 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  40.12 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  40.43 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  34.1 
 
 		 437 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.61 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  31.28 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  33.92 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  33.87 
 
 		 434 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  33.99 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  35.11 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  33.41 
 
 		 426 aa  217  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.74 
 
 		 434 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  33.6 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.74 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  31.83 
 
 		 437 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  32.1 
 
 		 443 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  34.41 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.8 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  33.87 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  32.72 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  34.32 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.57 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  32.45 
 
 		 450 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  31.78 
 
 		 450 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.03 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  30.68 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.74 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.26 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  31.71 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.7 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  31.41 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  30.43 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  30.23 
 
 		 441 aa  199  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  32.21 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  33.82 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.97 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  32.6 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  31.67 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  32.59 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  32.72 
 
 		 474 aa  193  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  32.44 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  32.44 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  31.77 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  32.44 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  32.45 
 
 		 439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.02 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  31.41 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  32 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  33.15 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  34.23 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  30.48 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  29.93 
 
 		 424 aa  187  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  30.24 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  30 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  30.07 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  32.23 
 
 		 446 aa  186  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  30.66 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  30.25 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  28.93 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  30.25 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  29.62 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  32.37 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 442 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 431 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  27.09 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  29.52 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  28.47 
 
 		 422 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.47 
 
 		 422 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  31.89 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  33.53 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.91 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  31.79 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  33.05 
 
 		 463 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  29.85 
 
 		 403 aa  180  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  27.88 
 
 		 423 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>