195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2126 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  41.5 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  32.05 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  34.59 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  34.34 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  34.59 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  34.59 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  34.05 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  32.78 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  25.26 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  28.04 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  22.27 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  22.5 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.13 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  25.79 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  26.04 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.49 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  29.24 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  21.8 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  21 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  23.08 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  21.15 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  27.33 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  24.18 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  23.78 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  26.35 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  18.18 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  29.93 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  27.33 
 
 		 846 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.29 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  23.24 
 
 		 872 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  21.63 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0093  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  23.65 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  22.17 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  20.83 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  21.35 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  26.09 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  20.87 
 
 		 493 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  22.09 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  23.32 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  24.18 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 		 320 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  24.34 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  23.13 
 
 		 349 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  24.18 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  21.88 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  24.18 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  23.2 
 
 		 243 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  26.15 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  21.63 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  22.38 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  30.13 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  21.88 
 
 		 312 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  19.8 
 
 		 355 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  22.84 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  24.42 
 
 		 415 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  23.23 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  21.63 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.79 
 
 		 862 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  23.63 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  24.14 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.878148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  18.52 
 
 		 381 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  26.58 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.45 
 
 		 525 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  20.09 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1228  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.205695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  21.52 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  26.35 
 
 		 976 aa  48.9  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  24.49 
 
 		 446 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  24.84 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  21.21 
 
 		 229 aa  48.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0992  hypothetical protein  35.37 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  23.27 
 
 		 961 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  21.28 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  24.57 
 
 		 600 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  31 
 
 		 368 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  22.07 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  20.31 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0752  pentapeptide repeat protein  22.38 
 
 		 714 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  21.47 
 
 		 866 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.55 
 
 		 862 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  20.37 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  23.93 
 
 		 949 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.55 
 
 		 825 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>