More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0143 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  48.15 
 
 		 757 aa  672    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  48.76 
 
 		 753 aa  690    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 864 aa  1752    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  48.7 
 
 		 756 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  48.5 
 
 		 754 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  47.81 
 
 		 761 aa  662    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  40.18 
 
 		 786 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  37.64 
 
 		 793 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 866 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  27.48 
 
 		 959 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 835 aa  258  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 836 aa  223  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 798 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 798 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 798 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 798 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 814 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 812 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 798 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 798 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 798 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  27.31 
 
 		 798 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 882 aa  202  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 923 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 870 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 831 aa  190  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 798 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 875 aa  134  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 815 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 879 aa  123  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 838 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 794 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.23 
 
 		 833 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 817 aa  82.8  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 787 aa  81.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 812 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  30.84 
 
 		 851 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  28.62 
 
 		 821 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  27.33 
 
 		 851 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 828 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 836 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 803 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  27.44 
 
 		 799 aa  72.4  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  27.12 
 
 		 812 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.86 
 
 		 801 aa  70.9  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 778 aa  71.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 822 aa  69.7  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 804 aa  69.7  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 1020 aa  69.7  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 810 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.75 
 
 		 862 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.16 
 
 		 862 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 798 aa  68.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 833 aa  68.2  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  33.96 
 
 		 812 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 822 aa  67.4  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  31.36 
 
 		 989 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 841 aa  67  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 811 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 825 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 796 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.75 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  24.24 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  31.55 
 
 		 930 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  33.52 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.5 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 811 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 986 aa  64.3  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 810 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 828 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  28.08 
 
 		 633 aa  63.9  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 883 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 779 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 841 aa  63.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 844 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 809 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 806 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  26.74 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 808 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 817 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 800 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  26.95 
 
 		 802 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  29.44 
 
 		 809 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 796 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 		 808 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.22 
 
 		 1186 aa  62  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1188 aa  62  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 981 aa  62  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 797 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  20.94 
 
 		 802 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  38.68 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 1040 aa  61.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 926 aa  60.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>