More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3566 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  46.08 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0880  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0874  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0891  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  27.51 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 176 aa  72  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 193 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  25.44 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  19.89 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  25.13 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  22.55 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
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NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
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NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
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