More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1641 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  100 
 
 		 145 aa  282  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  53.47 
 
 		 205 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  43.97 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  34.51 
 
 		 207 aa  88.2  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 251 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 214 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 210 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 202 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 209 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 247 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  27.34 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  27.46 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.69 
 
 		 205 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 200 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.31 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 236 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 236 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  31.31 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  32.37 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  29.57 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  41.43 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  29.46 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 220 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 257 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 242 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  21.99 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 208 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  27.66 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  46.15 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 214 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 273 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  28.79 
 
 		 207 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 289 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 209 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 309 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 207 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  29.81 
 
 		 246 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 234 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>