More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4040 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 540 aa  1083    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  57.03 
 
 		 527 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  40.86 
 
 		 1764 aa  292  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  38.48 
 
 		 577 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  38.43 
 
 		 578 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.71 
 
 		 574 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 542 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 608 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 602 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 637 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 1827 aa  242  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 681 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 601 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 1450 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 780 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 688 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 1005 aa  230  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 1038 aa  229  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 1034 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 529 aa  227  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 583 aa  227  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 3145 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 523 aa  223  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  37.18 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  35.98 
 
 		 703 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.21 
 
 		 603 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.89 
 
 		 1077 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.86 
 
 		 620 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 472 aa  213  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 620 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 		 648 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 714 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.01 
 
 		 689 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.83 
 
 		 626 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 		 767 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.44 
 
 		 626 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 614 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 955 aa  208  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 614 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 662 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.47 
 
 		 626 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 646 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.47 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 		 740 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 502 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.47 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 502 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  34.31 
 
 		 502 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 		 649 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 		 649 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 639 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  35.39 
 
 		 636 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.98 
 
 		 714 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 935 aa  198  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 637 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.84 
 
 		 636 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 615 aa  196  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 546 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.85 
 
 		 454 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 747 aa  193  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.97 
 
 		 760 aa  193  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 635 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 635 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.92 
 
 		 1677 aa  190  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 653 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.2 
 
 		 653 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.13 
 
 		 611 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.67 
 
 		 550 aa  182  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 747 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 923 aa  181  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 		 1073 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  35.01 
 
 		 412 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 1212 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 595 aa  177  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.84 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 611 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.51 
 
 		 615 aa  173  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 607 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  31.73 
 
 		 872 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.57 
 
 		 595 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  37.42 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 588 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  34.64 
 
 		 385 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0115  TPR repeat-containing protein  31.24 
 
 		 579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  33.06 
 
 		 600 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  30.8 
 
 		 705 aa  166  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 496 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 573 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 559 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 593 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.41 
 
 		 545 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>