More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0620 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2395  transcription-repair coupling factor  35.82 
 
 		 1162 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000829473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  37.39 
 
 		 1169 aa  781    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  35.97 
 
 		 1148 aa  665    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  35.7 
 
 		 1157 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  36.09 
 
 		 1162 aa  676    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  34.53 
 
 		 1220 aa  675    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  47.35 
 
 		 1155 aa  686    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  51.34 
 
 		 1169 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  37.85 
 
 		 1179 aa  729    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  34.09 
 
 		 1157 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  50.29 
 
 		 1176 aa  684    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0997  transcription-repair coupling factor  34.35 
 
 		 1164 aa  670    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3157  transcription-repair coupling factor  33.88 
 
 		 1164 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  36.42 
 
 		 1160 aa  697    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  50.29 
 
 		 1176 aa  684    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  50.29 
 
 		 1178 aa  684    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  50.29 
 
 		 1176 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  36.39 
 
 		 1153 aa  678    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0031  transcription-repair coupling factor  34.46 
 
 		 1195 aa  639    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  35.14 
 
 		 1167 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  45.13 
 
 		 1207 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  34.88 
 
 		 1148 aa  672    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  34.98 
 
 		 1167 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2685  transcription-repair coupling factor  34.24 
 
 		 1218 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1656  transcription-repair coupling factor  34.41 
 
 		 1146 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1978  transcription-repair coupling factor  33.05 
 
 		 1159 aa  668    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3189  transcription-repair coupling factor  33.15 
 
 		 1218 aa  646    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  36.74 
 
 		 1196 aa  731    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2406  transcription-repair coupling factor  35.91 
 
 		 1162 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00482386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  32.81 
 
 		 1193 aa  648    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  50.29 
 
 		 1176 aa  684    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  33.39 
 
 		 1161 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  50.93 
 
 		 1168 aa  653    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1935  transcription-repair coupling factor  34.06 
 
 		 1216 aa  662    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.671489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1968  transcription-repair coupling factor  33.5 
 
 		 1156 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.095546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  49.33 
 
 		 1174 aa  675    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  43.71 
 
 		 1158 aa  636    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  35.79 
 
 		 1157 aa  691    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  38.98 
 
 		 1177 aa  729    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  50.29 
 
 		 1176 aa  684    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  35.98 
 
 		 1197 aa  728    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  34.63 
 
 		 1153 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  34.19 
 
 		 1156 aa  659    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  36.56 
 
 		 1183 aa  773    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  50.44 
 
 		 1176 aa  683    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1952  transcription-repair coupling factor  35.91 
 
 		 1162 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00516748  normal  0.328047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  33.3 
 
 		 1208 aa  663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  33.84 
 
 		 1147 aa  665    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2504  transcription-repair coupling factor  33.99 
 
 		 1167 aa  646    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0917157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  33.13 
 
 		 1150 aa  665    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  33.88 
 
 		 1168 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  38.07 
 
 		 1178 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2717  transcription-repair coupling factor  34.25 
 
 		 1201 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1859  transcription-repair coupling factor  33.45 
 
 		 1156 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0201793  hitchhiker  0.000194707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  34.7 
 
 		 1179 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  39.18 
 
 		 1141 aa  688    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  47.73 
 
 		 1183 aa  695    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1013  transcription-repair coupling factor  33.57 
 
 		 1205 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0526678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  35.31 
 
 		 1197 aa  749    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  50.93 
 
 		 1168 aa  653    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  36.25 
 
 		 1151 aa  703    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6135  transcription-repair coupling factor  33.42 
 
 		 1156 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.352842  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  35.1 
 
 		 1169 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  50.44 
 
 		 1176 aa  684    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2511  transcription-repair coupling factor  35.91 
 
 		 1165 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00100471  normal  0.47703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1569  transcription-repair coupling factor  35.13 
 
 		 1184 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.878317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  39.4 
 
 		 1162 aa  790    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  39.23 
 
 		 1162 aa  787    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0929  transcription-repair coupling factor  33.36 
 
 		 1180 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  50.07 
 
 		 1176 aa  675    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  36.1 
 
 		 1160 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  36.19 
 
 		 1160 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  35.2 
 
 		 1166 aa  687    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  37.04 
 
 		 1178 aa  685    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1244 aa  2511    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  46.2 
 
 		 1123 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1932  transcription-repair coupling factor  33.62 
 
 		 1185 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  39.18 
 
 		 1170 aa  783    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  48.87 
 
 		 1162 aa  640    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  50.23 
 
 		 1188 aa  645    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1165 aa  674    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  35.53 
 
 		 1154 aa  663    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  35.95 
 
 		 1157 aa  689    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  36.88 
 
 		 1150 aa  722    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1944  transcription-repair coupling factor  33.42 
 
 		 1156 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  38.1 
 
 		 1189 aa  674    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  35.13 
 
 		 1198 aa  695    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  39.23 
 
 		 1176 aa  760    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8585  transcription-repair coupling factor  35.79 
 
 		 1204 aa  695    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1580  transcription-repair coupling factor  33.83 
 
 		 1163 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  35.08 
 
 		 1165 aa  738    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  50.29 
 
 		 1176 aa  684    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  35.6 
 
 		 1155 aa  713    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2848  transcription-repair coupling factor  34.79 
 
 		 1164 aa  665    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.420758  normal  0.818462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  38.98 
 
 		 1177 aa  738    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  40.04 
 
 		 1165 aa  775    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  48.08 
 
 		 1176 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  44.44 
 
 		 1157 aa  635  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  42.88 
 
 		 1182 aa  634  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0039  transcription-repair coupling factor  34.37 
 
 		 1193 aa  633  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>