More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3926 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  83.87 
 
 
219 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  83.87 
 
 
219 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  83.87 
 
 
219 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  84.33 
 
 
217 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  82.95 
 
 
217 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  78.71 
 
 
204 aa  328  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  56.88 
 
 
219 aa  252  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
234 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
219 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  36.99 
 
 
235 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 
218 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  33.13 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
205 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
205 aa  63.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
196 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
219 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  47.95 
 
 
215 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 
198 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 
208 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  49.25 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
204 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
204 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
198 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  38.27 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.17 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 
217 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
202 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  35.21 
 
 
198 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
196 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
205 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
184 aa  55.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 
214 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
182 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  47.92 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  42 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 
216 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
190 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
210 aa  52.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 
203 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
228 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
205 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  40.35 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
212 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
210 aa  52  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
233 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
203 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>