166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00920 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  44.64 
 
 		 214 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  42.92 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  42.92 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  42.38 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  38.49 
 
 		 211 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  38.98 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  36.1 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 230 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  34.6 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  41.07 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  43.75 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  29.78 
 
 		 190 aa  72  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  49.33 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  32.85 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 150 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  39.82 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
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NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  32.03 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 400 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
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NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 188 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
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NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
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