More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0437 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  88.5 
 
 		 1547 aa  907    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  91.63 
 
 		 1550 aa  936    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  93.84 
 
 		 1527 aa  944    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  73.57 
 
 		 1560 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  92.72 
 
 		 583 aa  860    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  86.65 
 
 		 1520 aa  924    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  91.7 
 
 		 1551 aa  934    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 598 aa  1226    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  89.05 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  48.48 
 
 		 1609 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  42.47 
 
 		 1573 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1620 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  35.95 
 
 		 1626 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  38.69 
 
 		 1586 aa  317  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  38.08 
 
 		 1554 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0439  YD repeat-containing protein  99.32 
 
 		 148 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703325  normal  0.248849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  38.15 
 
 		 553 aa  302  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  39.8 
 
 		 1362 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  35.78 
 
 		 1602 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  36.55 
 
 		 1576 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  34.58 
 
 		 1400 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  34.04 
 
 		 1572 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  35.89 
 
 		 1611 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  35.5 
 
 		 1568 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  36.98 
 
 		 1614 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  34.91 
 
 		 1411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  35.56 
 
 		 924 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  37.97 
 
 		 1446 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  36.21 
 
 		 1421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  33.44 
 
 		 866 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  36.48 
 
 		 1348 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  34.97 
 
 		 1531 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  34.74 
 
 		 1409 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  34.61 
 
 		 867 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  33.71 
 
 		 1385 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  33.06 
 
 		 1583 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  33.84 
 
 		 1386 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  32.87 
 
 		 1586 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  35.43 
 
 		 1595 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  32.39 
 
 		 1604 aa  238  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  35.09 
 
 		 561 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  33.27 
 
 		 1419 aa  229  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  33.4 
 
 		 1379 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1654 aa  226  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  32.83 
 
 		 1402 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  32.92 
 
 		 1410 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1418 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  31.12 
 
 		 1390 aa  217  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  35.83 
 
 		 480 aa  210  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  30.21 
 
 		 1384 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  37.05 
 
 		 451 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  33 
 
 		 1434 aa  200  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1319 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  31.85 
 
 		 1509 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  28.96 
 
 		 1530 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.98 
 
 		 1359 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  29.6 
 
 		 1388 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1405 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  28.74 
 
 		 1410 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  30.66 
 
 		 682 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  29.89 
 
 		 1429 aa  187  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  30.02 
 
 		 1490 aa  187  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  29.62 
 
 		 1405 aa  186  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  29.43 
 
 		 1426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  30.97 
 
 		 1543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  29.6 
 
 		 1426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  30.29 
 
 		 1400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  30.2 
 
 		 1415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  28.69 
 
 		 1268 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1216 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  30.28 
 
 		 1200 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  30.41 
 
 		 1259 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  30.48 
 
 		 1429 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1677 aa  180  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  28.79 
 
 		 1377 aa  180  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  28.65 
 
 		 1411 aa  180  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  28.82 
 
 		 1377 aa  179  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1494 aa  179  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  29.04 
 
 		 1397 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1397 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  28.89 
 
 		 1397 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  28.65 
 
 		 1411 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1411 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  28.5 
 
 		 1411 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  29.58 
 
 		 1417 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  28.67 
 
 		 1411 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  29.8 
 
 		 1673 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 1251 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  29.73 
 
 		 1398 aa  177  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  34.39 
 
 		 1317 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  29.19 
 
 		 1679 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  29.36 
 
 		 1593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.2 
 
 		 1527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  29.61 
 
 		 1365 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1189 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  30.45 
 
 		 1229 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.96 
 
 		 1981 aa  171  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>