212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3904 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  99.11 
 
 		 369 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  99.11 
 
 		 369 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  99.11 
 
 		 369 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  99.11 
 
 		 369 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  71.82 
 
 		 369 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  58.43 
 
 		 349 aa  114  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  54.55 
 
 		 341 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  61.73 
 
 		 276 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  59.76 
 
 		 338 aa  103  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  55.06 
 
 		 387 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  54.55 
 
 		 324 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  71.88 
 
 		 386 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  65.62 
 
 		 384 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  65.62 
 
 		 387 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  48.31 
 
 		 387 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  65.57 
 
 		 387 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  65.57 
 
 		 387 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  60.94 
 
 		 387 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  60.94 
 
 		 387 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1723  prophage DLP12 integrase  59.42 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.241784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1546  prophage DLP12 integrase  59.42 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1525  phage integrase family site specific recombinase  55.56 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  44.71 
 
 		 353 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  55.56 
 
 		 251 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  47.5 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  54.1 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  46.48 
 
 		 343 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  43.42 
 
 		 429 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  47.69 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  43.08 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  51.56 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  46.88 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  51.56 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  35.42 
 
 		 367 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  46.03 
 
 		 359 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  50 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  44.44 
 
 		 421 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  47.37 
 
 		 397 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  41.33 
 
 		 411 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  45.31 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  42.62 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  32.76 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  41.33 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  48.21 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  48.21 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  39.19 
 
 		 384 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  44.44 
 
 		 401 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  34.91 
 
 		 374 aa  53.9  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  37.04 
 
 		 405 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  36.07 
 
 		 354 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  43.86 
 
 		 384 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  36.25 
 
 		 332 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  30.77 
 
 		 335 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  40.7 
 
 		 313 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  38.46 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  39.06 
 
 		 356 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  54.55 
 
 		 407 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  33.77 
 
 		 380 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  38.96 
 
 		 388 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  29.59 
 
 		 451 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  32.58 
 
 		 339 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  33.33 
 
 		 335 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 456 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  37.1 
 
 		 413 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  33.71 
 
 		 339 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  37.93 
 
 		 396 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  35.06 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  38.81 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  57.14 
 
 		 275 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  30.21 
 
 		 451 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  37.7 
 
 		 451 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  41.79 
 
 		 335 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  36.99 
 
 		 406 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  36.84 
 
 		 336 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  34.57 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  33.78 
 
 		 444 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  38.1 
 
 		 328 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  39.47 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  38.67 
 
 		 345 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  38.33 
 
 		 375 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  30.12 
 
 		 380 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  32.35 
 
 		 330 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  49.06 
 
 		 372 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1565  integrase family protein  43.48 
 
 		 376 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0206581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  40.35 
 
 		 347 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  41.27 
 
 		 348 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  41.38 
 
 		 340 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  34.62 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  40.98 
 
 		 434 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  35.59 
 
 		 331 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  29.23 
 
 		 337 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  33.33 
 
 		 425 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  37.33 
 
 		 381 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  35.59 
 
 		 331 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  42.86 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  37.33 
 
 		 381 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  30.28 
 
 		 333 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  43.33 
 
 		 379 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  37.33 
 
 		 381 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>