More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0228 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  99.54 
 
 
439 aa  892    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  78.13 
 
 
439 aa  708    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
439 aa  895    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  86.56 
 
 
438 aa  761    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  64.22 
 
 
440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  53.95 
 
 
448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
387 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
382 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 
414 aa  147  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
428 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
433 aa  123  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  29.51 
 
 
412 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 
412 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 
423 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 
410 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 
484 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 
428 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
422 aa  97.8  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
421 aa  97.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
513 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.33 
 
 
421 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
428 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
444 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.39 
 
 
423 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 
439 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.7 
 
 
422 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
423 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
410 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
421 aa  90.9  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
424 aa  90.1  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
436 aa  90.1  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
423 aa  89.7  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  26.67 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.15 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.37 
 
 
426 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.37 
 
 
426 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.37 
 
 
426 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.37 
 
 
426 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
444 aa  87.8  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
420 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
419 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 
419 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
436 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.3 
 
 
399 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.17 
 
 
426 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.28 
 
 
326 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 
466 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
428 aa  84  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
449 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.33 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.11 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 
464 aa  82  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
430 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
423 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5060  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5800  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307701  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  22.14 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  28.09 
 
 
450 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
450 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
450 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  26.3 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
498 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 
477 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.7 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  26.1 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>