More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2609 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  100 
 
 		 780 aa  1562    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  60.85 
 
 		 751 aa  858    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  56.16 
 
 		 774 aa  817    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  56.91 
 
 		 767 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  60.91 
 
 		 773 aa  890    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  37.86 
 
 		 803 aa  476  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  40.18 
 
 		 801 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  39.09 
 
 		 779 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  51.53 
 
 		 805 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  35.27 
 
 		 681 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  34.54 
 
 		 833 aa  346  8e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  30.94 
 
 		 829 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  33.09 
 
 		 763 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  33.08 
 
 		 745 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  31.27 
 
 		 720 aa  310  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  30.51 
 
 		 819 aa  306  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  32.7 
 
 		 733 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  31.42 
 
 		 775 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  31.91 
 
 		 775 aa  287  4e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  31.94 
 
 		 772 aa  277  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  30.78 
 
 		 686 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  39.7 
 
 		 797 aa  221  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  38.74 
 
 		 784 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  30.14 
 
 		 807 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  28.7 
 
 		 780 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  29.61 
 
 		 774 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  27.99 
 
 		 757 aa  205  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  29.61 
 
 		 774 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  38.68 
 
 		 794 aa  205  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  28.63 
 
 		 717 aa  203  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  29.97 
 
 		 777 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  29.97 
 
 		 771 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  29.56 
 
 		 803 aa  200  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  39.67 
 
 		 756 aa  198  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  28.9 
 
 		 787 aa  195  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  27.42 
 
 		 793 aa  193  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.23 
 
 		 740 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  28.4 
 
 		 814 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  28.27 
 
 		 791 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  28.51 
 
 		 805 aa  187  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  26.79 
 
 		 789 aa  187  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  27.89 
 
 		 738 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  27.65 
 
 		 728 aa  183  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  27.2 
 
 		 783 aa  181  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  26.73 
 
 		 747 aa  180  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  35.27 
 
 		 751 aa  180  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  26.84 
 
 		 787 aa  178  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  26.84 
 
 		 781 aa  177  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  26.74 
 
 		 752 aa  177  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  26.69 
 
 		 781 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  25.26 
 
 		 641 aa  171  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  26.63 
 
 		 750 aa  171  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  27.96 
 
 		 774 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  25.27 
 
 		 803 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  35.61 
 
 		 766 aa  167  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  25.23 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  27.14 
 
 		 736 aa  165  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  35.26 
 
 		 793 aa  165  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  26.41 
 
 		 804 aa  162  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  26.4 
 
 		 783 aa  161  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  25.68 
 
 		 748 aa  160  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  33.7 
 
 		 776 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  27.97 
 
 		 892 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  25.94 
 
 		 703 aa  154  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  25.73 
 
 		 650 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  27.84 
 
 		 655 aa  153  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  26.02 
 
 		 654 aa  152  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  25.76 
 
 		 753 aa  152  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  24.74 
 
 		 711 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  26.34 
 
 		 654 aa  150  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  34.92 
 
 		 716 aa  150  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  26.86 
 
 		 696 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  33.02 
 
 		 781 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  26.03 
 
 		 704 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  25.57 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  28.88 
 
 		 700 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  28.88 
 
 		 700 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  32.29 
 
 		 810 aa  145  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  28.63 
 
 		 705 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  25.66 
 
 		 660 aa  144  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  32.4 
 
 		 757 aa  144  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  32.4 
 
 		 757 aa  144  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  32.4 
 
 		 757 aa  144  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  32.4 
 
 		 757 aa  144  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  32.4 
 
 		 750 aa  144  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  32.4 
 
 		 757 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  28.27 
 
 		 702 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  26.86 
 
 		 705 aa  142  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  27.87 
 
 		 704 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  28.02 
 
 		 705 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  32.4 
 
 		 744 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  27.51 
 
 		 710 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  29.55 
 
 		 799 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 703 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  24.7 
 
 		 682 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  25.74 
 
 		 681 aa  140  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 706 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  22.69 
 
 		 733 aa  140  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.54 
 
 		 662 aa  140  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  25.45 
 
 		 660 aa  139  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>