More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0371 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
805 aa  1622    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  33.5 
 
 
814 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.33 
 
 
813 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.1 
 
 
817 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.42 
 
 
823 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.59 
 
 
807 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  33.74 
 
 
797 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.97 
 
 
822 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.27 
 
 
805 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.01 
 
 
805 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  33.21 
 
 
805 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.57 
 
 
807 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  33.74 
 
 
869 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.05 
 
 
882 aa  376  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  31.78 
 
 
821 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.17 
 
 
816 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.95 
 
 
883 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.53 
 
 
844 aa  365  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.66 
 
 
809 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.11 
 
 
802 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  32.8 
 
 
805 aa  353  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  31.83 
 
 
809 aa  353  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.15 
 
 
808 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  31.06 
 
 
796 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.15 
 
 
871 aa  350  8e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.24 
 
 
805 aa  348  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.86 
 
 
862 aa  345  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  33.62 
 
 
808 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  30.33 
 
 
809 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  31.65 
 
 
798 aa  338  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  30.46 
 
 
804 aa  334  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.22 
 
 
849 aa  330  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.39 
 
 
821 aa  330  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.5 
 
 
819 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.7 
 
 
812 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  31.37 
 
 
808 aa  327  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.72 
 
 
855 aa  327  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.27 
 
 
913 aa  324  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.72 
 
 
915 aa  320  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  30.74 
 
 
810 aa  320  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  30.27 
 
 
803 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.21 
 
 
845 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  30.91 
 
 
831 aa  317  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.69 
 
 
878 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  31.55 
 
 
804 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.97 
 
 
874 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.42 
 
 
887 aa  304  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.7 
 
 
817 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.02 
 
 
919 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  30.88 
 
 
800 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.28 
 
 
893 aa  297  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.7 
 
 
810 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  31.72 
 
 
816 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.6 
 
 
803 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.42 
 
 
879 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  31.17 
 
 
808 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.54 
 
 
884 aa  290  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  31.06 
 
 
808 aa  289  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.14 
 
 
880 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.15 
 
 
817 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  29.33 
 
 
803 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  30.12 
 
 
865 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  30.59 
 
 
810 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  31.65 
 
 
806 aa  271  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.77 
 
 
820 aa  266  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  30.59 
 
 
811 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.7 
 
 
835 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  28.8 
 
 
887 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.7 
 
 
888 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 
813 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  29.35 
 
 
819 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  30 
 
 
844 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  27.88 
 
 
843 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  30.52 
 
 
848 aa  243  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  26.83 
 
 
810 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.03 
 
 
846 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
809 aa  237  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  28.77 
 
 
861 aa  231  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.94 
 
 
807 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 
810 aa  207  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.97 
 
 
828 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  27.61 
 
 
931 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 
770 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 
802 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
810 aa  145  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 
798 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  24.8 
 
 
791 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 
794 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 
793 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 
800 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 
790 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 
801 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
791 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  23.43 
 
 
784 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  26.63 
 
 
800 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  22.24 
 
 
795 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 
811 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 
784 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 
789 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 
788 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>