205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2962 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  343  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  48.94 
 
 		 917 aa  85.1  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  42.72 
 
 		 914 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  32.95 
 
 		 996 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  34.62 
 
 		 1010 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  32.37 
 
 		 996 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  31.55 
 
 		 1042 aa  75.1  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  32.35 
 
 		 996 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  43.16 
 
 		 798 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  30.99 
 
 		 995 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  30.46 
 
 		 971 aa  68.6  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  30.23 
 
 		 1004 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  31.45 
 
 		 853 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  32.11 
 
 		 702 aa  67.8  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  42.55 
 
 		 802 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2360  UvrD/REP helicase  28.82 
 
 		 955 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  32.54 
 
 		 996 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  40 
 
 		 798 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 743 aa  63.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  41.24 
 
 		 758 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 798 aa  62.4  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  40.62 
 
 		 804 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  41.49 
 
 		 798 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  26.87 
 
 		 817 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  33.96 
 
 		 694 aa  62  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  35.23 
 
 		 695 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  34.17 
 
 		 689 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08201  DNA topoisomerase III  38.71 
 
 		 734 aa  60.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  27.69 
 
 		 812 aa  60.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3599  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  32.48 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000119283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  39.36 
 
 		 799 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  35.23 
 
 		 700 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  35.23 
 
 		 700 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0359  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  37.89 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3672  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  31.62 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3770  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  31.62 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3707  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  31.62 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281277  normal  0.131734 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  32.98 
 
 		 694 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  30.07 
 
 		 704 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  34.69 
 
 		 836 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3600  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  31.62 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0707644  normal  0.764114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3766  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  34.95 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000848781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  38.78 
 
 		 789 aa  57.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  32.35 
 
 		 765 aa  57.4  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  32.99 
 
 		 760 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3579  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  34.95 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0127763  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  32.35 
 
 		 765 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  55.32 
 
 		 685 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  34.86 
 
 		 765 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  35.58 
 
 		 748 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  30.28 
 
 		 746 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3715  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  31.62 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  hitchhiker  0.00891628 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  34.09 
 
 		 700 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  29.47 
 
 		 814 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00387  DNA topoisomerase A  34.58 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03134  predicted DNA topoisomerase  33.98 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0430  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  33.98 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00343806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  31.19 
 
 		 768 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002062  Zn-finger domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  34.62 
 
 		 751 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0430  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  33.98 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00156622  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4606  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  33.98 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00790504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3477  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  33.98 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000183076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03085  hypothetical protein  33.98 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  36.84 
 
 		 767 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2469  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  33.03 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  29.47 
 
 		 814 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  33 
 
 		 841 aa  54.3  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  31.87 
 
 		 836 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  31.58 
 
 		 853 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  29.09 
 
 		 793 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  33.52 
 
 		 978 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  30.14 
 
 		 851 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  31.07 
 
 		 759 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  31.07 
 
 		 759 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  34.62 
 
 		 780 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  30.14 
 
 		 851 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  53.19 
 
 		 685 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  30.69 
 
 		 691 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  33.7 
 
 		 859 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3965  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  34.74 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0249698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4508  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  34.65 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000112025  hitchhiker  0.000168776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  31.2 
 
 		 894 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  46.94 
 
 		 684 aa  51.2  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  46.94 
 
 		 684 aa  51.2  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0442  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  34.74 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826807  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  46.94 
 
 		 684 aa  51.2  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  27.91 
 
 		 783 aa  50.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  35.53 
 
 		 972 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0028  DNA topoisomerase I  31.25 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3786  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  33.68 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000331014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 756 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  48.94 
 
 		 684 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  48.94 
 
 		 685 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 714 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  51.06 
 
 		 685 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0319  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  35.79 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020229  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0008  DNA topoisomerase I-related protein  31.31 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0040  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  31.53 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000217946  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0620  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  32.26 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000280134  normal  0.0216681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>